Instrukcje: Dołącz do Distributed Computing projektów, które przynoszą korzyści ludzkości

Original:  http://www.hyper.net/dc-howto.html


Co zrobić, jeśli niektóre na świecie szacuje 650 mln szt (i 250 milionów gospodarstw domowych z dostępem do szerokopasmowego Internetu) może być związane z pomóc naukowcom w rozwiązywaniu problemów krytycznych Realu? To jest dokładnie to, co humanitarnej siatki obliczeniowej jest o!
Darować twój rachmistrz CPU czas bezczynności do projektów humanitarnych non-profit badań naukowych. Pomóc znaleźć leki chorób takich jak rak, AIDS, cukrzycy, MS, Alzheimera lub pomoc przewidywania zmian klimatycznych na ziemi, lub postępu w nauce np. wyszukiwanie fal grawitacyjnych, pomoc CERN budować swoje najnowsze akcelerator cząstek lub Berkeley Szukaj extraterrestrial Intelligence. Więc chcesz przyczynić się, ale nie wiesz, gdzie zacząć lub jak to zrobić najlepiej? A może jesteś już przyczyniając się do jednego z bardziej znanych projektów, takich jak [email protected] lub [email protected] i czegoś więcej?
[Jak ClimatePrediction.net] istnieje wiele projektów Distributed Computing (D.C.) żąda CPU czas składki. Jest to próba kategoryzowania różnych humanitarnej D.C. projektów, głównie w odniesieniu do wymogów technicznych (a w niektórych przypadkach, linki z uwagi na ich zasług naukowych).
Spędziłem sporo czasu patrząc jak najlepiej to zrobić. Mój logistycznych przy wyborze projektów: możliwe wartości dla świata/człowieka typu not-for-profit, wyniki udostępnione do domeny publicznej, efektywnego wykorzystania zasobów moich komputerach, bezpieczne i łatwe w utrzymaniu. Będę podzielić się moje wnioski tutaj, aby inni mogli korzystać też. Z mojego (użytkownika CPU czas dawcy) perspektywy, będzie podzielić projekty DC na dwie kategorie: BOINC i nie BOINCOWYCH. Zawsze wolą BOINC, w przypadku gdy jest to możliwe.
Uwaga: Humanitarnej sieci komputerowych krajobraz zmienia się szybko, jak przybywają nowe ekscytujące projekty, inni wstrzymać lub przerwać itp. Tak dużo informacji tam w Internecie mogą być nieaktualne, nawet jeśli napisał 6-miesięcy temu. Ten dokument zawiera najnowsze informacje na DC computing w maju 2007 i wszystko przedstawione tutaj została sprawdzona najlepiej jak potrafię.
I. BOINC
BOINC (Berkeley otwartej infrastruktury dla sieci komputerowych) będzie mój ulubiony sposób na komputerze doświadczonych użytkowników, którzy planują, aby przyczynić się do wielu projektów. To jest wolne, open source oprogramowanie, które działa w systemie Windows (XP / 2K/2003/NT/98/ME), Linux / FreeBSD / Unix i Macintosh. “Distributed Computing ramy” stworzony przez Berkeley Univ. Po instalacji/konfiguracji BOINC, można “subskrybować” tak wiele projektów, jak chcesz i automatyzują wszystko. Uczestnicy dołączyć jeden lub więcej projektów BOINC rejestrując konto (nazwa i hasło) na stronie projektu.
Informacji na temat BOINC: BOINC domu, BOINC Pobierz, BOINC Linux Debian/Ubuntu, Wiki: Instalacja i uczestniczących w BOINC projektów BOINC OcUK FAQ, BOINC beta sw
Krótkie podsumowanie informacji o BOINC: jest to oprogramowanie, które pozwala na udział w wielu projektach i do kontrolowania, jak twój PC czas dzieli się wśród tych projektów. Projekty niezależne, a każdy utrzymuje własne serwery. Każdy może stworzyć projekt BOINC. Deweloperzy BOINC (Uniwersytetu Berkeley w Kalifornii) nie ma żadnej kontroli nad stworzeniem projektów BOINC i nie zawsze popiera je.
BOINC statystyki stats stats2 stats3: 1.000.000 ludzi i 2.000.000 komputery w 234 krajach Jun-2007
1. Life sciences (głównie biofizyki obliczeniowej) projektów BOINC
i. [email protected] białka przewidywanie i projekt projekt ([email protected] w Wikipedii, o nauce faq, medycznym, dziennik postępu) przez Baker Lab na Washington University, Stany Zjednoczone Ameryki. Rozwoju i stosowania oprogramowania Rosetta białka przewidywanie i projekt (darmowe licencji bezpłatnie do zastosowań akademickich).
ii. [email protected] białka prognozowania projektu przez Ecole Polytechnique, Francja (tylko klient WinXP)
iii. TANPAKU białka prognozowania projektu przez Tokyo University of Science, Japonia
iv. [email protected] (naukowe aktualizacji 1-Mar-06) białka prognozowania projektu przez Scripps Research Institute, USA.
v. Climateprediction.net (WCG, zobacz howto łączyć WCG przez BOINC) IBM inicjatywy dobroczynne. IBM płaci rachunki za telekomunikacyjnych i sprzętu, ale decyzja o którym not-for-profit projekty do sponsora, jest podejmowana przez international Advisory Board. WCG działa 5 projektów:
1. Człowieka Proteom składane (HPF, HPF na Wikipedii, przeczytaj o HPF) przez Instytut systemy biologii (ISB), Stany Zjednoczone Ameryki. 1 faza stosowane Rosetta v4.2x oprogramowanie na ludzkiego genomu i zakończeniu Lis-05. Faza HPF-2 (HPF2) stosuje się Rosetta v5.x w trybie “pełne dopracowanie atom”. HPF-2 Aktualizacja 23-cze-06, 13-Mar-06 Aktualizacja, aktualizacja 17-Jan-06 i HPF-1 Podsumowanie 22-listopada-05)

2. [email protected] przez laboratorium Olson w Scripps Research Institute, dotyczy sw AutoDock do badania interakcji leków z różnych form proteazy HIV. Faza 1 będzie ekran 2000 związki z 270 wariant szczepów HIV. Związki wybranych przedstawicieli wielu różnych grup. On dołączył do WCG w Nov05 i BOINC w Jan06. Ostatnia aktualizacja 19-Jan-06
3. Pomoc pokonać raka badania na tkanki microarrays (TMA), które obiecują, aby pomóc lekarzom w wyborze właściwego leczenia i zapewniając dokładne prognozy dla chorych na raka. Zaczął lipiec 2006
4. Porównanie genomu projektu przez Oswaldo Cruz Institute, Fiocruz, Brazylia. Celem jest poprawa białek funkcjonalnych adnotacji w bazach danych.
5. Pomóc leczyć dystrofia mięśniowa przez Decrypthon, partnerstwo między AFM (French Dystrofii Stowarzyszenia), CNRS (francuskiego Narodowego centrum badań naukowych)
vi. SIMAP (projekt ma obecnie nie pracy) białka podobieństwa bazy danych wspólny projekt GSF Narodowego centrum badań środowiska i zdrowia, Neuherberg i Uniwersytet Techniczny w Monachium, centrum życia i nauki Weihenstephan, Niemcy
Kursywa = projektu BOINC jest nadal w fazie beta testów, lub zawieszone
vii. [email protected] projekt ma na celu pogłębienie wiedzy atomowej szczegóły interakcji białko ligand i robi tak, będzie wyszukiwania dla spojrzenie na odkrycie nowych leków. Alfa badania
viii. [email protected] badania białka składane kinetyki, za pomocą dynamiki molekularnej, przez Stanford University, USA (Uwaga [email protected] aktualne oprogramowanie działa samodzielne, ale [email protected] ma beta-sw na platformie BOINC łączyć). Dowiedz się więcej na [email protected] w Wikipedii, co to jest [email protected] faktycznie pracujesz? Działa już od ponad 5yr i jest obecnie najwyższą projekt profilu DC po legendarnym [email protected]. Google umieścił go jako część ich GoogleToolBar w latach 2003-2004, cieszył się reklamy i został zainstalowany na ponad 1,5 mln szt., z których obecnie ponad 200.000 nadal aktywnie computing dla [email protected] oferuje trwałe moc ponad 200 teraflopów.
ix. MalariaControl.Net stochastyczne modelowanie, Epidemiologia kliniczna i historii naturalnej malarii Plasmodium falciparum.
 Badania białka jest szczególnie ważne, ponieważ większość chorób przejawia się na poziomie aktywności białka. To również jeden z najbardziej wymagających obliczeniowo naszej ery (w surowej energii). Zarówno na świecie #1 (IBM Blue Gene/L, zakończone 4Q05, pokazano zdjęcie) i superkomputerów #2 (IBM Blue Gene) zostały zbudowane głównie z badań białka. Blue Gene/L ma stała prędkość 100 teraflopów, wolontariuszy z całego świata przyczynić się już ponad 200 + TeraFLOPS (ponad dwa razy moc obliczeniową na świecie #1 superkomputera, żeby projekt [email protected] Stanford) i innym 200 + teraflopów do projektu [email protected]! Gridowych jest naprawdę potężny!
Cele i różnice projektów life science
Jeśli odwiedzałeś strony projektu powyżej, większość mówić o “zwijania białek”. Tym samym, konkurencyjnych, uzupełniające? Jak one związane z uzdrowień chorób takich jak rak lub AIDS? pytania, na które każdy pyta.
Krótkie podsumowanie:
Większość chorób przejawia się na poziomie aktywności białka. Wąskie gardło w badaniach medycznych dla wielu chorób, jest to, że roli funkcji wielu białek (ok. 60%) w organizmie człowieka nadal pozostaje nieznane. W rzeczywistości, projekt Find-a lek zamknięte w gru-05 po uruchomieniu od 4 lat, bo zabrakło nowych białek, znanych funkcji, aby sprawdzić za pośrednictwem “wirtualny pokaz” (zobacz moda do zamknięcia). Pierwszy kształt 3D białek ma być zidentyfikowany, z której naukowcy oczekiwać dowiedzieć się więcej o funkcji tych białek, jak kształt białek jest nieodłącznie związane z jak funkcjonują w naszym ciele.
Białka 3D kształt identyfikacji jest obecnie wykonywana “eksperymentalnie” w laboratorium (za pośrednictwem rentgenografia i NMR) w wielkim kosztem czasu i pieniędzy więcej (btw niektóre większe białka trudne do badania “eksperymentalnie”). “Białko przewidywania” projektów, takich jak [email protected], TANPAKU, [email protected], [email protected] (a także obecnie nieaktywne rozproszonych składane) wszystkie rozwijają algorytmów do określenia 3D struktur białkowych “matematycznie” (za pomocą symulacji komputerowych, znany również jako “przewidywanie struktury białek” lub “zwijania białek”), które przyspieszy postępy ogromnie. Te same narzędzia oprogramowania również ostatecznie mogłoby zostać użyte do projektowania nowych białek złożonych, które spowoduje wyłączenie organizmów chorobotwórczych (np. wirusy jak typowe “grypa” i HIV/AIDS lub bakterii) lub naprawy uszkodzonego DNA (np. terapia genowa” dla leczenia raka). Inne oprogramowanie wykonuje “obcinania” kontrole potencjalnych leków (małe cząsteczki) do docelowego białka (“wirtualny pokaz”).
Projekty jak człowieka Proteom składane stosuje “białka przewidywanie” algorytmy opracowane przez jedną z wyżej wymienionych projektów (HPF jest za pomocą Rosetta), do generowania prognoz 3D struktury dla wybranych białek (np. HPF2 badania raka biomarkery), biologów i biomeds przyjrzeć się podczas “Adnotacje” białek (podejmowanie decyzji, co robią, które komórki związane z procesami).
SIMAP oblicza podobieństwa pomiędzy białkami, podobnie wymodelowany białka zwykle wykonywać te same funkcje (tzw orthologs).
Do leczenia choroby, w poszukiwaniu naukowcy krótkoterminowych, medyczny narkotyków poprzez “wirtualny pokaz” / “obcinania” “ligandów” (małe rozpuszczalnych w wodzie chemicznych cząsteczek które potencjalnie mogą być wykorzystywane jako leki, czyli które będą współdziałać z białka za chorobą hamują lub uaktywnić) na znanych białek, które już zostały określone dla chorób. Takie projekty obejmują CureCancer, [email protected], [email protected], ComputeAgainstCancer, D2OL i znaleźć w narkotyków (nieaktywne) za pomocą oprogramowania “dokowania” (np. dok, LigandFit, AutoDock, myślę, Rosetta itp).
Kolejnym krokiem w leczeniu choroby (być może od lat) jest zaprojektowanie nowych białek (sztuczne) do wykonywania funkcji, np. [email protected]’s pracy na raka z przebudowy DNA-modyfikacja białka (terapii genowej).
[email protected] używa dynamiki molekularnej (prawa fizyki) do badania procesu białka składane (“kinetyka”) i zrozumieć misfolding (agregacji) chorób takich jak choroba Alzheimera. Również do opracowania nowych, bardziej dokładne białka lek “obcinania” metody.
Projekty Life science szczegółowo:
[email protected], [email protected], TANPAKU, [email protected] wszystkie starają się przewidzieć 3D struktury białek nieznanej jeszcze z ich aminokwasu sekwencji, więc naukowcy biomed można wywnioskować rolę każdego białka / funkcje w komórce procesów (więcej szczegółów później w sekcji Trafności projektów przewidywanie białka do kuracji). Jest różnica w podejściu do rozwiązania problemu, np. Rosetta używa funkcji energii do znalezienia najniższej i najbardziej stabilny stan i predykcyjne zastosowań symulacji Monte Carlo, korzystanie z wiedzy w oparciu pole siłowe w oparciu o model uproszczony kraty.
[email protected] jest projektem chemii obliczeniowej zaawansowanych, który bada, jak złożyć białek. Co jest [email protected] faktycznie pracujesz? Chemia rozłożeniu, częściowo składane i całkowicie składany (“macierzystego”) białek, jest zainteresowany jak odnoszą się one do siebie. Nie próbuje przewidzieć struktury końcowy białka 3D z sekwencji aminokwasów, ale próbuje symulować proces składania w pico-/ czasowych mikrosekund, w dół na poziomie cząsteczki białka, Pokaż naukowców, co faktycznie dzieje się podczas składane za pomocą dynamiki molekularnej (z prawami fizyki). Tak, [email protected] jest informatyka białka składane “drogi” (“trajektorii”), jak filmu animowanego (np. “Toy Story”): ramka po ramce, trwające od mikrosekund do kilku milisekund, próbuje nauczyć się wystarczająco dużo o krytycznych części, by stworzyć lepszy model procesu zwijania białek, jak również zrozumieć misfolding (związane z agregacja) chorób takich jak choroba Alzheimera. Takie podejście wymaga ogromnych mocy do symulacji nawet małe, szybkie Składanie białek obliczeniowej, tak obecnie to nie nadające się do przewidywanie 3D struktury białek.
SIMAP: Ze względu na ogromną ilość białka znanych sekwencji w publicznych baz danych stało się jasne, że większość z nich będzie nie być doświadczalnie charakteryzuje się w najbliższej przyszłości. Niemniej jednak białka, które często zmieniały się od wspólnego przodka Podziel się te same funkcje (tzw orthologs). Tak to można wywnioskować funkcji białka nie charakteryzuje się z ortholog ze znanych funkcji.
HPF (człowieka Proteom składane) dotyczy oprogramowania przewidywania struktury 3D (Rosetta w szczególności). Należy pamiętać, że właśnie zakończył fazy-1 HPF i Jan-06 projekt udał się do fazy-2 (HPF2) [więcej].Jest tu wyciąg z dyskusji“Jest tam żadnych wyników w leczeniu lub możemy rozwiązać tylko więcej i więcej białka?”):
[zabawki budowlane] “Projekt człowieka Proteom składane jest podstawowych badań medycznych. Podano niektóre podstawowe składniki komórek (białka o nieznanej funkcji) i staramy się wywnioskować, ich kształt, a następnie z tego wywnioskować, jakie inne białka ich interakcji z, i jak. To jak wylewanie części “zestaw Erector” (redaktor: zabawki budowlane) na podłodze salonu i próbuje dowiedzieć się, co dzieje się z tym, co. Celem jest dowiedzieć się funkcjonalny sieci tego dysku procesy podstawowe komórki. Po zidentyfikowaniu funkcji białka, można:
  1. Zaznacz go jako miejsce docelowe dla lek koliduje z jego funkcji
  2. Dowiedzieć się, jak to działa i projektowania lek powielić efekt
  3. Opracowanie testu diagnostycznego do wykrywania stężenia tego białka w celu zmierzenia poziomu aktywności
Bez informacji o białka te trzy rzeczy bardzo ważne cele, które można osiągnąć tylko przy masowych badań przesiewowych ogromnej liczby związków chemicznych, mając nadzieję na szczęście przełom. Nawet z tej informacji dużo pracy, umiejętności i szczęścia jest zobowiązany do opracowania leku.
Projekt HPF może zapewnić bardzo przydatne informacje dla opracowywania leków, ale jest jej celem podstawowym, który można następnie wykorzystać do opracowania leków. Dostarczamy dane kształtu. Naukowcy badający baz danych z tej informacji strukturalnych będzie przewidzieć funkcji białek (białka adnotacji).”
Trafności projektów przewidywanie białka ([email protected], [email protected], [email protected], TANPAKU itp.) do znalezienia lekarstwa na raka, AIDS, Cukrzyca, Stwardnienie rozsiane i inne choroby [source source2 źródło]
[wstążka świadomości raka] Dlatego, że to może być trudne do znalezienia projektu, który działa bezpośrednio na temat leczenia raka jest że rak jest taki ogromny, skomplikowane choroby, która tak wiele rzeczy zaangażowane w. Jeden może studiować jak genu czynnika wzrostu można uruchomić z kontroli, lub genetyki za guz tłumika lub sygnalizacji udział w szlaku śmierci zaprogramowane komórki lub czynników środowiskowych, które prowadzą do mutacji, lub kilkanaście innych rzeczy, które przyczyniają się do raka, ale to wszystkie te połączone w sposób wyjątkowy, który może prowadzić do różnych typów nowotworów.
Rak jest rzeczywiście wynikiem mutacji na poziomie DNA, często wiele mutacji (co jest znane jako “hipoteza 2-hit”). Jednak aby te mutacje rzeczywiście powodować raka, musi aktywować program wyrażenia genu, który zależy działanie wielu białek. W związku z tym, kierowanie DNA do naprawy (terapia genowa) jest jeden podejścia do leczenia raka, ale innym podejściem (i być może bardziej wykonalne w krótkim okresie) jest miejsce docelowe białka zaangażowane w niekontrolowanego wzrostu komórek.
W związku z tym niektóre z najbardziej obiecujących najnowsze metody leczenia nowotworów pochodzą z leków, które miejsce docelowe specyficznych białek zaangażowanych w raka (np. leki, które miejsce docelowe aktywność kinazy tyrozynowej białka czynnika wzrostu). Największy sukces w takie odkrycie leku ma pochodzić z osłaniania dużych bibliotek cząsteczki pochodzące z chemii obliczeniowej. Takie podejście jest bardzo czasochłonne i kosztowne i nawet nie gwarantowane. Inne podejście do odkrywania leków pochodzi z “wirtualny pokaz” lub “racjonalne projektowanie” na podstawie doświadczalnie rozwiązany 3D struktur białkowych. Wymaga to najpierw istniejącej struktury białek i sposób oceny skuteczności leku interakcji ze strukturą. Opracowanie metod przewidywanie struktury białek w sposób racjonalny bezpośrednio odnosi się do wykrywania narkotyków w ten sposób, nie tylko do projektowania metod leczenia raka, ale dla wielu innych chorób.
Jak widać, trudno bezpośrednio dotyczą projektów przewidywanie struktury białek do raka, ale oni pracują na rzecz rozwoju technologii, które pomogą odkrycie leków, aby pomóc w leczeniu takich chorób.
Więcej na temat “wirtualny pokaz”:
Badań skupia się na białka, które zostały uznane za docelowe np. terapii nowotworów. Poprzez proces zwany “wirtualny pokaz”, specjalne analizy oprogramowania określi cząsteczek, które współdziałają z tych białek i określi, które molekularnej kandydatów ma wysokie prawdopodobieństwo rozwijany do lek. Proces jest podobny do znalezienia prawo klucz, aby otworzyć specjalne blokady przez patrząc na miliony milionów molekularnej “kluczy”. Jeśli wiemy, że struktury białek odpowiedzialnych za cukrzycę, na przykład, czy ich działalność musi być zwiększona lub zmniejszona, możemy poszukać małych cząsteczek, które hamują białka albo przyśpieszyć.
Dowiedz się więcej o “racjonalne narkotyków projekt” i “wirtualny pokaz”: Wikipedia: narkotyków projekt, Wikipedia: dokowania cząsteczek.
Białka projekty tło informacji (można pominąć, jeśli nie jesteś zainteresowany w nakrętki i śruby badań)
Baker ([email protected] głowa naukowiec) wyjaśnia:
“Z zakończeniem projektu poznania ludzkiego genomu, teraz jesteśmy zdolne do przewidywania, co będzie sekwencji aminokwasów różnych białek w organizmie człowieka. Jednak, chociaż wiemy, że kolejność aminokwasów, białka nie pozostają w dwa kształty wewnątrz ludzkiego ciała. One “wchodzisz” na różne kształty trzech różnych białek aby służyć ich funkcji wewnątrz ludzkiego ciała. Z łańcuchem charakterystyczne aminokwasów białka nie po prostu wchodzisz w sposób przypadkowy, ale zwykle składa się w określonej konfiguracji. Siłą tego zjawiska jest uważana za efekt hydrofobowy. Efekt ten jest ze względu na fakt, że grupy aminokwasów są przyciągane lub odpychane przez wody, dlatego będzie próbował maksymalizacji lub minimalizacji narażenia wody odpowiednio. Od płynów, które instytucje życia składają się z przede wszystkim składa się z wody, te łańcuchy aminokwasów wchodzisz na siebie z łańcuchami odpychane przez wody z tendencją do być częścią centrum białka, aby zminimalizować ilość ich powierzchni narażonych na płyny w organizmie. Te łańcuchy aminokwasów, które są przyciągane do wody wydają się być częścią powierzchni białka w celu zwiększenia proporcji łańcucha narażać się płynów w organizmie. Od sił, które działają na białko zależy od tego, jaka jest kolejność poszczególnych aminokwasów białka, konkretnego białka będzie zazwyczaj “złożyć” w ten sam sposób. Ze względu na złożoność siły działające na wystarczająco duże, aby stworzyć białko, sekwencji aminokwasowych to jest bardzo trudne do przewidzenia, jak białko będzie krotnie, ale ta wiedza jest istotne dla określenia jak funkcji białka. Opracowanie sposób, aby szybko i dokładnie przewidzieć, jak będzie krotnie białka potencjalnie może pozwolić na naukowców do opracowania metod leczenia chorób takich jak choroba Alzheimera i AIDS.
[białka] Za pomocą dynamiki molekularnej, istnieje możliwość korzystania z podstawowych praw fizyki do symulacji procesu składania dla danego białka. (Na przykład projekt [email protected].) Jednak takie podejście ograniczone w jego użyteczność, ponieważ wymaga ogromnej mocy obliczeniowej do symulacji nawet białka proste składanie zachowanie. Projekt [email protected] ma inne podejście, wykorzystując nowo opracowane oprogramowanie algorytm próbuje przewidzieć kształt, że białko będzie najprawdopodobniej wchodzisz do. Fragment dodatkowe oprogramowanie analizuje prognozowanych wyników i określa, która z różnych prognozowanych wyników jest najbardziej prawdopodobne być poprawne. Wykorzystując rozproszonych projekt≤w obliczeniowych, to można szybko utworzyć bazę danych miliardy możliwych struktur białek, a tym samym uzyskać dokładne zdjęcie co to składany białka chcieliby wyglądać.”
Warto przeczytać informacje naukowe dla wolontariuszy “foldery”: Wikipedia: przewidywanie struktury białek
Więcej informacji na temat białka badania projektów (Rosetta, predykcyjne, WCG, [email protected], SIMAP) różnice: tło o oprogramowaniu Rosetta i jego wykorzystanie w ISB w HPF projektu BOINC Wiki.
Artykuł Gene maszyny w WIRED.com (2001) daje “informacje” i opowiada o świecie największych superkomputerów, zbudowany dla zwijania białek. Myśliwi białka, przewodowe Apr-01. Białka projektowania procesów biologicznych warfare obrony projektu, przez DARPA. Białka składane przegląd artykułów na ten temat zwijania białek i choroby.
2. Fizyka, klimat, itp SETI BOINC projektów
i. [email protected] wyszukiwania danych z Laser Interferometr grawitacyjne wave Obserwatorium (LIGO) w USA i w GEO 600 fal grawitacyjnych Obserwatorium w Niemczech dla sygnałów pochodzących z szybko obracających się gwiazdy neutronowe, znany jako pulsarów.
ii. Jak ClimatePrediction.Net aka CPDN. Krótkie podsumowanie: CPDN projektu działa duża typu Monte Carlo symulacji parametrów globalnego obrotu modelu (UMK), w celu poprawy klimatu prognoz dla XXI wieku, i należy obliczyć błędy. Mimo, że obecnie istnieje powszechna zgoda, że temperatura wzrośnie, prognozy wielkości wraz ze wzrostem temperatury różnią się ogromnie. Zmiana klimatu jest postrzegane jako główne zagrożenie dla naszej cywilizacji. Jest to współpraca między kilka uniwersytetów i organizacje w Wielkiej Brytanii. Projekt poszedł na żywo we wrześniu 2003. W lutym 2006 roku dołączył do BBC. Czytaj więcej z BBC BBC zmian klimatycznych, CPDN projektu na BBC news. Nie łączyć tego projektu, jeśli twój komputer działa tylko kilka godzin tygodniowo.
[Jak ClimatePrediction.Net]
Celem jak ClimatePrediction.Net jest przewidywanie zmian klimatu na całym świecie w 21 wieku. Sposobem na to jest na początek Najlepsza Pogoda środki, najlepsze szacunki parametrów, które rządzą kształtowanie klimatu, i przeprowadzić symulację na Super-komputer.

Problem z tej techniki jest to, że ignoruje to główny problem: nie mamy środków dokładnie wszystkich parametrów bieżącej sytuacji i, co gorsza, mamy tylko oszacowanie nieprecyzyjne niektóre parametry kluczowe symulacji. Przykładowo wskaźnik, w której CO2 jest pochłaniana przez oceany nie jest znana z dokładnością. Jest to jeden z powodów, dlaczego obecnie mamy sprzeczne długoterminowych prognoz klimatu. Jeśli parametry źle symulacji jest bezwartościowe.
W rzeczywistości możemy uzyskać informacje z wynikiem symulacji nawet, jeśli zaczyna się od parametrów, które nie bardzo dokładne. Ale potrzebujemy wielu z nich: tysiące, dziesiątki tysięcy, a może nawet więcej. Poprzez analizę wyników wszystkich tych symulacji jeden lepiej zrozumieć wpływ poszczególnych parametrów i, określić, co jest najbardziej prawdopodobnym wynikiem, a także określić, które najbardziej istotne parametry.
Ale nawet Super-komputer jest do tego zadania. Tak więc pomysł aby każdy symulacji na innym komputerze przy użyciu zapasowe cykli procesora i Internet do zbierania wyników. Oto jak to działa: zespół ClimatePrediction rozpowszechnia oprogramowanie symulacyjne, dane klimatyczne i zestaw parametrów, które mają być testowane. Program to symuluje ewolucji klimatu w ciągu dziesięcioleci modelu i następnie zwraca wyniki do zespołu ClimatePrediction.
Więcej informacji na temat CPDN naukowych strategii.
Zalety: Praktyczne projekt z niektórych piękna grafika symulacje UMK.
Wady: Klient jest duży i dane projektu można ponad 1 GB. Jeden blok danych zajmuje dużo czasu, aby obliczyć: 2.4 GHz Pentium-4 zajmie około 3 tygodnie (działa 24/7).
iii. [email protected], legendarny projekt Uniwersytetu Berkeley, rozpoczęła się w 1999 roku. Największy projekt w historii z ponad 5 milionów użytkowników. Celem projektu jest, aby odkryć oznak inteligencji pozaziemskiej (tam jest tak cenne mało tego na ziemi). Deep space sygnały radiowe zebrane przez anteny radiowej Arecibo w Puerto Rico w podziale na WUs i przetwarzane przez komputery klienckie. SETI pracuje teraz dostać online tablicy radio telescope “Paul Allen” (na cześć współzałożyciel firmy Microsoft, który zrobiłem duże wpłaty).
iv. Leiden klasycznego pulpitu komputera sieci dedykowane do general Dynamics klasycznego
v. [email protected] (w dół od września 2006 roku) pomaga budowa LHC (Large Hadron Collider). Będzie to największy i najpotężniejszy akcelerator, jaki kiedykolwiek zbudowano. [email protected] symuluje, jak cząstki podróży koryta tunelem o długości 27 km. Z pomocą dane obliczeniowe magnesy, które kontrolują belka może być skalibrowany z większą precyzją.
[email protected] został stworzony przez i opiera się w CERN-ie, który znajduje się w Genewie, Szwajcaria.
vi. Quantum Monte Carlo ([email protected]) opracować metodę Quantum Monte Carlo dla ogólnego użytku w chemii kwantowej. BETA-testy
vii. [email protected] badania cząsteczek nano magnetyczne. W przyszłości tych cząsteczek będzie używany w lokalnych nowotwór chemioterapia i rozwijać małe moduły pamięci. BETA-testy
viii. [email protected] do symulacji systemów nanotechnologii na dużą skalę BETA-testów
Istnieje wiele więcej projektów BOINC, te wymienione powyżej po prostu humanitarnej z nich (np. złamanie algorytmów szyfrowania mogą być ciekawe wyzwanie, ale to nie jeden, że korzyści ludzkości) miałem okazję przyjrzeć się bliżej dalece. Jestem pewien, że istnieją inne projekty godni, by otrzymać czas bezczynności procesora. Można znaleźć w sekcji linki na końcu.
Niektórzy ludzie stają się tak entuzjastycznie, że tworzą one “komputer gospodarstw”, zbudowany do “kryzysu” (obliczyć) jak najwięcej. I konkurują ze sobą dla uzyskania większości kredytów (prac) na swoje ulubione projekty.
Dowiedz się więcej nie oficjalnej BOINC Wiki, BOINC stronę w Wikipedii, [email protected] stronę w Wikipedii.
II. Ne BOINCOWYCH
Projekty wymagające autonomicznego agenta oprogramowania
Zalety: Ułatwia ustawienie dla niezaawansowanych użytkowników (bez rejestracji-projekt i konfiguracja wymagane). Przydatne, jeśli chcesz przyczynić się do tylko jednego projektu, lub jeśli twój ulubiony projekt nie jest dostępny za pośrednictwem BOINC. Jeśli zdecydujesz się pójść w ten sposób (nie BOINCOWYCH), należy albo bec nie jesteś bystry komputera lub bec, naprawdę chcesz przyczynić się do szczególnych nie BOINCOWYCH projektów.
Wady: W przeciwieństwie do projektów BOINC, autonomicznych agentów często wzajemnie się wykluczają: np. Jeśli korzystasz z FightAIDS i spróbuj zainstalować Oxford przeciwnowotworowe projektu, Instalator poprosi Cię do WCG un rata (patrz komentarz). Więc nie można uruchomić zarówno projektów. Także w niektórych przypadkach w przeszłości, firm użyć niewielką część (1%) CPU czas uruchomić projektów interes handlowy (skutecznie staje się “pośredników” czasu procesora) i zwrócić część wpływów do użytkowników lub wpłat to dla nich na cele charytatywne.
Większość z tych projektów wspierane przez duże firmy np.: IBM lub Intel dla obrotu obsługa (czyli “widoczność” i firma “public relations”). Nie mogę pomóc, widząc, że komercyjnie wspierane projekty wydają się umieścić hasłami jak “rak” lub “Pomocy” w tytule, który naprawdę zdobyć uwagę ludzi
Projekty, które poruszają się na “własne” DC platformy oprogramowania (ale wszystkie z wyjątkiem grid.org/Oxford już lub wkrótce będą na BOINC także) obejmują:
 
i. [email protected] prowadzony przez Stanford Univ badanie białka składane (nauka za projekt). Obecnie najwyższym profilu projektu DC w Internecie po [email protected]. Obsługiwane przez firmę Intel, Google i innych z powrotem w latach 2002-2003 pozwoliły uzyskać bardzo dużą bazę użytkowników i kwitnącej społeczności użytkowników (forum, zespoły rywalizujące oddać większość czasu procesora itp) instrukcji instalacji. wprowadzenie w języku greckim, napisany przez siebie. Aktualne oprogramowanie [email protected] działa samodzielne, ale [email protected] przygotowuje beta do przyłączenia się do BOINC. [email protected] w Wikipedii.
[email protected] statystyki: ludzie 522.000, 180.000 aktywnych procesorów (z 1.5million) od lip-06
ii. Climateprediction.net (formalnie IBM IBM płaci rachunki za sprzęt serwera i sieci, ale decyzja na projektów do wsparcia jest podejmowana przez Advisory Board), oferuje 2 DC platform: Eter Wielka urządzenia oprogramowanie (tylko dla klientów systemu Windows) lub oprogramowanie BOINC (Linux i Windows). Polecam, łączącą WCG przez BOINC. WCG systemu Windows agenta, oparty na technologii UD, może być łatwiejsze w instalacji (odpowiednie dla mniej doświadczonych użytkowników komputerów) ale BOINC oferuje większą elastyczność. WCG odbywają się obecnie 5 projektów (wyjaśnione bardziej szczegółowo w sekcji BOINC-Przyrodniczy tego dokumentu):
  • Proteom człowieka składane
  • FightAIDS
  • Pomóc pokonać raka
  • Porównanie genomu
  • Pomóc leczyć dystrofia mięśniowa
Statystyki WCG: 200.000 osób ponad 370,000 procesorów (aktywne)?
IBM jest Instalacja agenta WCG (automatycznie, jako “zalecane oprogramowanie” więcej) do ich strony korporacyjne. W sposób jeden można myśleć o WCG jako ramy DC “ekonomicznie” run / obsługiwane dla wielu projektów (obecnie hosting 3 projektów). Projektów, które otrzymują wsparcie dostaje decyzją Rady Doradczej. To jest biegać i utrzymywane przez IBM (gdy jeden łączy, rzeczywiście wprowadzeniu prawnej umowy z IBM). IBM twierdzi, że kontroli projektu będzie ostatecznie przenoszone do odpowiedniego podmiotu non-profit po projekt dostaje się mocno na jej nogi.
Cytat z WCG End User License Agreement
“WITAMY W ŚWIECIE WSPÓLNOTY SIATKI. JEST TO UMOWA, KTÓRA ODNOSI SIĘ DO UDZIAŁU W CLIMATEPREDICTION.NET. TO JEST MIĘDZY TOBĄ A INTERNATIONAL BUSINESS MACHINES CORPORATION (USTOSUNKUJEMY SIĘ DO SIEBIE JAKO “IBM” LUB “MY”). PRZEWIDUJE SIĘ, ŻE OSTATECZNIE IBM BĘDZIE PRZENIESIENIE CLIMATEPREDICTION.NET OBIEKT NIE FOR-PROFIT BĘDĄCYCH WŁASNOŚCIĄ INNYCH PODMIOTÓW. TAKI TRANSFER BĘDZIE STANOWIĆ WKŁAD IBM. JEŚLI I KIEDY TO NASTĄPI, NINIEJSZA UMOWA BĘDZIE RÓWNIEŻ ZASTOSOWANIE DO PODMIOTU.”
WCG jest dostępny jako projekt BOINC, a teraz jeden można również dostosować zasoby procesora lub zrezygnować z jego poszczególnych podprojektów (I nie przeszkadza, zarówno HPF i FightAIDS równie dobre imo). Normalnie UD/WCG i BOINC/WCG użytkownicy otrzymają jednostki pracy obu projektów automatycznie.
iii. Grid.org [nieaktywny] (formalnie Wielka urządzenia, która ustanowiła grid.org jako “proof of concept” dla swojego oprogramowania siatki, aby wykazać zasadność i korzyści dużych internetowych siatki obliczeniowej). Jego głównym projektem jest od Oksfordu na raka. Oprogramowanie działa w systemie Windows (98/ME / 2K/XP) tylko (nie Linux lub Mac).
Grid.org statystyki: 1.3million ludzie, 3,5 mln procesorów (ale zastanawiam się, ilu z nich aktywne?)
  • Leczyć raka [zakończone] aka wygaszacz ekranu-ratownik. Prowadził od 2001 r. do kwietnia 2007 roku, przez Oxford University chemia Dept (UK) z NFCR (Narodowej Fundacji do badań nad rakiem), wspierany przez UnitedDevices i Intel. Ten projekt jest za pomocą oprogramowania LigandFit do testowania 3.5billion chemicznych z białek raka, białaczki i raka trzustki, dwa z najbardziej śmiercionośnych rodzajów raka. Tak w istocie jest to ogromny układanki, która jest rozwiązywane przez brutalnej siły. Od Jan06 w 2 fazie to jest rafinacji przed “hity”, skutecznie najmu naukowcy wiedzą, co nie poświęcić swój czas, pieniądze i zasoby na. Na ten sam temat (ale starszych) Q&A informacja z NFCR NCFR-Oxford-UD wygaszacz ekranu-ratownik projektu strony głównej. Aktualności Dec-2005 (więcej):
“Używając Screensaver ratownik / LigandFit technologii, które określiliśmy trzy obiecujące prowadzi Mol597, Mol238 i Mol628 dla Urokinaza hamowanie. W oparciu o badania dokowania tych cząsteczek wykazują wysoki potencjał jako inhibitory uPA. Cząsteczki te może służyć jako cząsteczek ołowiu do projektowania lepszych uPA inhibitory jako potencjalnych leków przeciwnowotworowych terapeutycznych. Jesteśmy syntezy tych cząsteczek i ich testowanie aktywności biologicznej.”
E-mailem informacje zwrotne od Prof.Richards 30-Lis-05 (źródła)
Wygaszacz ekranu projektu opracowała szereg ‘hity’; cząsteczki przewidywane do potencjalnych inhibitorów białek i możliwe prowadzi do wykrywania narkotyków. Szyjki butelki do eksploatacji tych przewidywań jest potencjalnie kosztowne syntezy związków i ich badań biologicznych.
Dla dwóch serii przeszliśmy etap i wyniki bardzo obiecujące.
Jest jednym z bardziej interesujących i ambitnych celów fosfatazy.
Wiele z biologii jest równowaga między fosfatazach i kinaz. Te ostatnie mają zostały ważne cele handlowe dla leków przeciwrakowych od wielu lat, ale fosfatazach okazały się bardziej trudne, jak na jedno biding witryny, do którego należy powiązać lek jest raczej niewłaściwie określone. Projekt produkowane niektóre 128.000 trafienia na ten cel. Analizowane wyniki i sporządził listę 400 dobrych przebojów różnych typów chemicznych. Te były syntetyzowane i przetestowane. Ponad 40 [~ 10%] okazał się prawdziwy inhibitory, które jest bardzo dobre standardy i co to jest więcej, one nieobciążania cząsteczek, które bardzo różni się od znanego inhibitorów. Staramy się znaleźć firmy farmaceutyczne do dodatkowe.
Do drugiej serii, gdzie celem jest Urokinaza aktywatora plazminogenu [zamieszany w raka prostaty] znowu mieliśmy syntetyzowane i przetestowane, tym razem przez współpracowników w Arizonie Cancer Center. To też ma produkowane, wspieranie nowatorskich związków aktywnych. Wyniki te zostały przedstawione w Amerykańskiego Stowarzyszenia badań nad rakiem i plakat zawierający dane wprowadzane jest na stronie internetowej Oxford chemii
  • Proteom człowieka składany o. Obecny II faza, faza, uruchomiono na WCG i Grid.org działa tylko na WCG (i przez BOINC/WCG, który jest, jak go uruchomić).
Find-A-Drug Project [nieaktywny] był pierwszym masowym DC zdrowia nauk projektu, patrząc pod kątem leki chorób takich jak rak, AIDS, stwardnienia rozsianego, SARS, malarii, choroby układu oddechowego, szalonych krów i innych. Ponownie Metoda była masa pokaz cząsteczek leku jak przed choroba białek, przy użyciu oprogramowania myślę. Zaczął kwi 02, zamknięte 16-Dec-05.
“Mamy również ukierunkowane większość celów uznanych białka obszarów dużego projektu. […] Nasze doświadczenie wskazuje, że będzie trudno znaleźć współpracowników, którzy będą zainteresowani wyników kierowania białek, których funkcje biologiczne jest nieznany lub mały odsetek terapeutycznych.”-Keith Davies, moda
W pierwszej fazie internet oparty anty-nowotworowych projekt≤w obliczeniowych “Wygaszacz ekranu ratownik” aka CureCancer, myślę, że oprogramowanie nauki i gospodarzem była Wielka urządzenia. We współpracy z Narodowej Fundacji badań raka (NFCR), Uniwersytetu Oksfordzkiego i Intel Corporation. Drugi etap projektu NFCR + Oxford + UD Cure-rak/wygaszacz ekranu-ratownik zdecydował się na korzystanie z oprogramowania LIGANDFIT. W tym momencie Keith Davies, który jest honorowy pracownik naukowy na Uniwersytecie i jest założycielem Treweren konsultantów, który myślę, że oprogramowanie, siedzibę znaleźć lek aby kontynuować korzystanie z oprogramowania myśleć badań.
v. computeagainstcancer.org (nieistniejącego? nowości nie aktualizowane od 2003 roku). Rozpoczęła lip-2000, sponsorowane przez PARABON obliczeń, gospodarze 3 projekty. Podobno firma zarabia sprzedając procent zasobów procesora agregacja do interesów handlowych. “Wybierając się do wzięcia udziału w obliczyć przed rakiem, a nie Parabon na standard dostawca programu, możesz po prostu wybrać oddać pieniądze, które chcieliby płacić za czas bezczynności komputera do miłości wybór.” (z ich FAQ)
vi. D2OL The Drug projektowania i optymalizacji Lab (D2OL) polega na poznawaniu kandydatów na leki przeciwko wąglika, ospa, wirusa Ebola i SARS i innych potencjalnie katastrofalne chorób zakaźnych lub bioterroryzm agentów. Wyjaśnienie “dokowania” Metoda patogenów
vii. Rozproszonych projektu składane obecnie nieaktywny
Uwaga: Samodzielne projekty wymienione powyżej tylko najbardziej szeroko stosowane (ponad 100 000 uczestników). Istnieje wiele więcej “samodzielne” rozproszonych projektów obliczeniowych. Można znaleźć więcej na stronach distributedcomputing.info i www.volunteerathome.com, z profilami rozległe, Lokalizacja projektu. To również wyjaśnia BOINC, WCG i UD. Mam nadzieję, że więcej będzie dostępny w ramach platformy BOINC w przyszłości, który udaje im się osiągnąć optymalną wydajność.

Uwagi:

Nie można pomóc, ale zauważ, że projekty life science pokładanych SETI userbase 5 mln. Na kredyt z Berkeley, stworzyli BOINC (dlaczego classic [email protected] jest zamykanie w dół), więc [email protected]’s ogromny userbase teraz zdecydować się na oddanie czasu procesora do innych projektów łatwo, gdy SETI nie dużo pracy (jak jest w przypadku ostatnio), który jest gorąco zachęcamy ludzi Berkeley/SETI. Każdy projekt można teraz wykorzystać tej ogromnej puli zasobów obliczeniowych.
Nadal, trendy prawdopodobnie wskazują, że Wspólnota “darowizny użytkownika” koncentruje się na bardziej “techniczne” projektów tj. SETI + CPDN + Einstein + LHC zużywają około 90% ogólnego czasu procesora BOINC. Myślę, że jednym z powodów jest to, że większość projektów “nauka” przybyły online za pośrednictwem BOINC niedawno, a także obawy dotyczące potencjalnego wykorzystania wyników badań biomedycznych przez BigPharma. Nauka projektów należy starać się rozwiązać te problemy. (Przeczytaj burzliwą dyskusję na forum rak UD-Intel i prośba o opinię na HPF forum, więcej wątpliwości i odpowiedzi). Regularne sprzężenie zwrotne jest ważne dla “morale wojsk” (nadal, dużo mocy procesora pójdzie do projektów z najładniejszą grafikę i fantazyjne statystyki). Osobiście chcę przejrzystości i pełnego ujawnienia.
Kwestie do rozważenia przy wyborze projektów:
  • Własności intelektualnej, czyli “własności” wyników. Jadą do stają się dostępne dla całego naukowego? np. wyciąg z [email protected] FAQ:
Pyt.: czy [email protected] non-profit? / Czy ktoś będzie zarabiać pieniądze z mojego czasu wpłat komputera?
A. The Univerity Washinton udostępnia kodu źródłowego (rzeczywiste Rosetta algorytmu, który naszej mocy oddanej komputer pomaga poprawić) dostępne dla nauczycieli akademickich oraz innych uczelni dla i w końcu udostępni kod źródłowy do publicznej wiadomości, gdy możliwości oszukiwanie problem na BOINC jest skierowana. Dr David Baker “wszystko będzie publicznie Nie, nie wierzę w naturalnie patentowania genów ocurring, białka, itp.”
Wiem, kto jest właścicielem zestawów danych, które pochodzą z procesora i przeczytać ich użycie zobowiązań względem prawnym no-nonsense. Jeśli one nie zdążyć łatwy wobec zlokalizować te warunki, a następnie znaleźć inny projekt.
  • Wyniki badań: miara przydatne wyniki z cytatów nie najlepszy środek, ale na pewno środek. Czy istnieje lista dokumentów, które mają ww prace wykonane przez projekt?
  • Co jest wąskim gardłem (najsłabszym ogniwem) z nauką robi? Jeśli więcej mocy obliczeniowej jest udostępniony, przydatne wyniki ukaże się szybciej? Czy jest to “najwolniejszy” część badania sami naukowcy? Idealnie chcemy czynnikiem ograniczającym się naukowcy, więc oni nie czekasz na wyniki naszej pracy. Zasadniczo będzie więcej przetwarzania szybkość nauki? I jaka jest Górna granica na przetwarzanie liczb, które powyżej którego nie będą przydatne (czyli, w jaki poziom mocy obliczeniowej będzie naukowcy mogą być czynnikiem ograniczającym?).
Możliwość kosztów, np. [email protected] wydaje się wszystkie “przetwarzania” będzie odbywać się w ciągu roku, a następnie zostanie wydane przez długi czas patrząc na “trafienia”. To jest tylko przykład naukowców jest wąskim gardłem, nie procesorów. (ważne pytania od [email protected] postów)
BOINC Wiki CPDN: Jak zdecydujesz się na udział zasobów oferuje więcej myśli w tej sprawie.

Mój wybór

Jak zdecydować które przyczyniają się do wszystkich projektów BOINC? Ze względu na większość projektów “nauka” o dołączył BOINC dość niedawno (np. [email protected] online wyszlo beta Nov05) reprezentowane w czas procesora. Patrząc na statystyki pod koniec 2005 r., około 90% wpłat czasu procesora przez BOINC idzie do SETI + CPDN + Einstein + LHC. WRT SETI to jest moja opinia, że jeśli ktoś chce szukać Extra-Terrestrial intelligence, jeden powinien być przede wszystkim zbadanie dowodów UFO, zamiast próbuje odebrać sygnały radiowe, ponieważ zaawansowana cywilizacja może być za pomocą różnego rodzaju fizyki, że nie wiemy o jeszcze, jak kwantowe splątanie, (choć na pewno radioastronomia jest wielkie okno na wszechświat).
W każdym razie [email protected] ma dużo mocy procesora już wystarczająco dużo, aby proces, który każdy WU 5 razy. To nie jest ograniczone przez dostępnych mocy procesora. W tym momencie [email protected] może używać więcej funduszy (darowizny pieniężne), a nie więcej procesorów.
WRT nauk fizycznych projektów myślę, że zrozumienie wagi pozwoli ludzkości, jej następny duży krok naprzód i zrozumienia wszechświata. Tak ważne zarówno Einstein i LHC.
Człowieka Proteom składane (WCG/HPF) który dotyczy oprogramowania Rosetta na Proteom ludzi wydaje również przydatne. WCG fora dyskusyjne (świetlna). Niestety, WCG w (IBM) redundancji bieżącego (replikacja początkowa, kworum) ustawienia po prostu zbyt rozrzutny.
Badania związane z projektu Rosetta, który bada białka kształt 3D przewidywania, jest konsekwentnie wśród najlepszych wykonywania metody ab initio przewidywanie w ostatnie dwa lata CASP eksperymentów i również nie choroby. Poprawa tych algorytmów ma efekt mnożnikowy na rzecz rozwoju innych programów (np. HPF).
[email protected] jest to najstarszy (od 2000) i największy projekt Przyrodniczy (białka badania) (choć jeszcze nie BOINCOWYCH). Jednak z biegiem lat, naprawdę nigdy nie rozumiał, jak nauka Sporządzono [email protected] ostatecznie doprowadzić do zabiegów i kuracji. Z [email protected] połączenia do identyfikacji celów leków i narkotyków projekt wydawał się bardziej oczywiste.
Tak w tej chwili mogę przekazać mój czas procesora
  1. [email protected] 40%
  2. [email protected] 30%
  3. SIMAP 15%
  4. Climateprediction.net (“Człowieka Proteom składane” i “FightAIDS”) 15%
CPDN jest kolejny projekt dobrze, ale dość ciężki i miłość wobec dodać go, działa na PC swój własny, w późniejszym momencie. Wiele projektów na mojej liście nowe i jeszcze stosunkowo mało uczestników.

Linki:

  • Wykaz projektów DC (te nie tylko pomocy humanitarnej, w bieżącym dokumencie)
    • distributedprojects.info lista projektów DC. pomocne profile i informacji na każdy temat
    • [email protected] projekt aktualne informacje, nowości, przyszłe projekty i linki
    • GridCafe projektu listy i athome
    • Lista projektów DC w Wikipedia, wolna encyklopedia
    • Inne listy projektów DC w DMOZ i infoanarchy.org
  • Forum / wiki / miejsc spotkań dla osób zaangażowanych w projekty DC
    • XPC xtremepccentral to jedne z najbardziej produktywnych crunchers DC wokół domu
    • Forum Darmowe-DC
    • Strefa DC
    • ArsTechnica DC zespołów, ArsTechnica dyskusji SETI, RC5, [email protected], [email protected], projekt rak UD i innych
    • Zespół Picard forum
    • Zespół SciFi od 1998
    • Prof. James Challis najbardziej doskonały zespół UK jest zespołu pracującego nad liczbą publicznych rozproszonego przetwarzania Internet projektów
    • FAD Beens były Find-a lek zespół członków, kładąc nacisk na projekty medyczne
    • OcUK UK overclockerów DC forum
    • Grupa holenderskich moc krów holenderskich DC
    • Zespół Hack-a-Day Wiki
    • Zespół [H] ardOCP DC dla ludzkości, koncentruje się na [email protected] i UD/grid.org
    • Zespół Phoenix Rising
    • Team Ninja
    • OcDistributed
    • BoincForum.info jest miejscem dla miłośników DC
    • Zespół BOINC UK
    • www.rechenkraft.net Niemczech Największe rozproszonych komputerów Wspólnoty
    • Rycerze, którzy mówią, Ni! Zespół KWSN DC
    • Projekt nadzieję, jeśli chcesz przyczynić się, ale nie są bystry komputera, Dołącz do grupy (Stowarzyszenie) gdzie jeden wkład funduszy ($$$) tak wiedzę/chętnych ludzi uruchomi Przyrodniczy DC w imieniu wszystkich w grupie
  • BOINC-podobne strony
  • Nieoficjalne BOINC Wiki dostawców odpowiedzi na pytania BOINC, przez Paul Buck
  • OcUK BOINC FAQ znakomite wprowadzenie przez OverclockersUK. Obejmuje wszystkie tła informacji, a także prosta instalacja, rozmieszczenia automatyczny/pilot/Non-Instalator/Auto-rata, zapory/serwery proxy i wiele więcej
  • Wybór projektów BOINC przedstawiono wymagania dotyczące pamięci każdego projektu
  • Top-100 BOINC także uczestników z ładne wykresy kołowe
  • [BOINC statystyki serwerów]
  • Krajowe/regionalne: BOINC Niemcy, BOINC Australia, BOINC Danii, Czech Rep, zespół Boinc.be, belgijski crunchers BOINC
  • Ranking BOINC
  • Innych źródeł klient BOINC sw, Crunch3r w, truXoft w i naparst w zoptymalizowany SETI i BOINC klientów
  • Papier na BOINC PDF obliczeniowych i możliwości przechowywania komputerów wolontariuszy, przez Berkeley (Anderson, Fedak)
    mundayweb osobisty BOINC statystyki licznika
    BOINCView aplikacji do zdalnego monitorowania wielu BOINC stacji roboczych (“bez głowy”)
    Instalacja Debiana Linux BOINC i Wiki dla Debiana i pochodne (np. Ubuntu), cpulimit ogranicznik użycie procesora dla systemu Linux
    Pakiet instalacyjny RedHat Linux BOINC obr. / min, wstępnie dla [email protected]
    BOINC i bezpieczeństwa podkład, bezpieczna instalacja BOINC pod Win i Linux
    Zautomatyzowanie wdrażania BOINC agenta sieci lokalnych Win szt
    BoincZilla BOINC błąd bazy danych
    Oznaczenia miejsc projektu BOINC dla Google Earth sw aby zobaczyć, gdzie na ziemi uczestników projektu znajdują się
    Próbki dla DC wniosek listów przekonać szefów szkoły lub biz pozwala uruchomić DC na ich komputerach (napisane dla [email protected], dostosować odpowiednio)
    Porównując wyniki zespołu DC w projektach, sklepienie DC SETI BOINC pracy zespołu statystyki
    W prasie
    Scientific American “Przetwarzanie nauki” maja 2005
    CNN: Supercomputing proste, logowania do rozwiązywania globalnych problemów przedstawiając IBM WCG, używać komputera do walki z rakiem, polowanie, cudzoziemców i więcej (2001)
    Gene maszyna “informacje” artykuł w WIRED.com (2001) o największym superkomputer IBM, zbudowany dla zwijania białek. Wyjaśnia problemów napotykanych przez naukowców. warto przeczytać dla wszystkich “foldery”
    Wybierz przycisk zasilania z komputera do walki z rakiem (2001) stary artykuł PC World
    Darować twój PC wolny czas, aby pomóc światu o IBM WCG, artykuł (listopad 2004) przez PC World
    HIV na WCG o IBM WCG, (wrzesień 2005)
    Gracze mogą pomóc leczyć raka? wniosek o najem konsole (Xbox i Playstation) czy zwijania białek (WIRED mag Jun-2005)
    Leczyć raka z twój komputer ABC News, Dec-2005, rozmowy o WCG i ComputeAgainstCancer
    FightAIDS nowości: IBM press release, BusinessWeek: Komputery dostać z programem pomocy, [email protected] idzie BOINC
    Nauki o życiu i zwijania białek
    Człowieka Proteom składanie informacji z WCG forum
    Bonneau Labs głowa naukowca strony
    HPF2 projektu aktualizacji 17-Jan-06 przez Bonneau, głowa naukowiec i
    Głowa naukowiec Bonneau Lab dla człowieka Proteom składanych projektów (HPF1, HPF2 itp.)
    Projekt daje znaczące wyniki (listopad 2005)
    W laika celów projektu
    Grudzień 2005 r. postęp aktualizacji Richard Bonneau
    Składanie białek i chorób i dyskusji na temat zwijania białek i choroby
    HPF jest całkowicie bezwartościowe? Q&A o przydatność HPF. Debata na Dlaczego przewidywania kształtu 3D białka zamiast eksperymentalne rentgenografia itp
    Rosetta oprogramowania i [email protected]
    Baker laboratorium domu Rosetta oprogramowania
    Robetta publiczne białka struktury prognozowania serwera za pomocą oprogramowania Rosetta
    Rosetta Cyberscience
    HHMI białka detektywi (Dec-05), na Baker (luty-01)
    Rosetta Fotografia
    Rosetta FAQ
    Komputery sprawiają, że wielkie postępy w przewidywanie struktury białek
    Wyniki [email protected]? Dyskusja w [email protected] użytkownika forum, podnoszenie pytania (dotyczy wszystkich projektów DC, ale Stanford Pande Grupa [email protected] jest najwyższym profilu, jeden obecnie)
    Pomiaru wpływu wydajności [email protected]
    Mike Houston ClawHMMER o wydajności ATI R520 GPU Stanford rozwija oprogramowanie (jak wiemy) do odciążania FLOP obliczeń do karty graficznej. Podsumowując, nowe GPU ATI ma ~ 71 sekund, aby zakończyć ilość pracy, że zajmuje Pentium 4 2.8 CPU ~ 1589 sekundy wobec zgłaszać reklamację.
    IBM Climateprediction.net
    Nieoficjalne WCG
    Konwersja z UD/WCG BOINC/WCG instrukcji
    WCG partnerów imponującą listę organizacji (korporacje, uniwersytety, Fundacji non-profit itp) z całego świata, wsparcie WCG
    Grid.org (Wielka urządzenia)
    CureCancer projekt forum NFCR, University of Oxford, Anglia, UD i członków UD wyszukiwania w leczeniu białaczki
    Różne
    Rozszyfrowanie komunikatu życia Zgromadzenia David Brown, MD, Washington Post personel pisarz
    International HapMap Project współpracy naukowców i agencji finansujących z Kanady, Chin, Japonii, Nigerii, Wielkiej Brytanii i Stanów Zjednoczonych, rozwój publicznych zasobów, które pomogą Naukowcy znaleźć genów związanych z człowieka choroby i reakcji na leki.
    Genetyka online zasobów edukacyjnych
    Badania genomu zasoby Online
    Genetyka online zasobów edukacyjnych
    Leczenia starzenia się 54 wiodących Naukowcy dokonali list otwarty pokazano jawne pewność, że choroba starzenia może i zostanie wyleczony.

    Zmagają się z klimatu zmiany Wired News rozmawiał z autorów trzech nowego, kompleksowego książek na globalne zmiany klimatyczne
    Na szeroką skalę badań przesiewowych wirtualnego papieru na znalezienie prowadzi do narkotyków projekt z D2OL
    Dokowanie ligand-białko: Cancer Research na styku papier biologii i chemii, streszczenie 2003
    DARPA białka projektowania procesów DARPA jest inwestowanie w rozwój nowych narzędzi w różnych obszarach topologii, optymalizacja, obliczenia ab initio potencjałów, syntetyczne chemii i informatyki prowadzi do możliwości projektowania białka na zamówienie. Na koniec tego programu Naukowcy spodziewają się możliwość projektowania nowego białka złożone, w ciągu 24 godzin, które spowoduje wyłączenie organizmów chorobotwórczych.
    TOP500 Super komputera witryny podobno niektóre z projektów wymienionych tutaj cieszyć się większą moc obliczeniową niż najnowszy superkomputer na świecie! Np. jak Jan06 [email protected] oferuje ponad 200 TFlops trwałej wydajności obliczeniowej, vs światowych superkomputerów góry 2, czyli IBM Blue Gene z maksymalnie 90TFlops i BlueGene/L z max 280TFlops (z których oba białka folderów)
    IBM Blue Gene world’s #1 superkomputer, zbudowany dla zwijania białek
    Mam nadzieję, że ten dokument będzie Ci się przyda
    Dimitris prof.
    e-mail: dhatz-dc w hyper.net
    Data ostatniej modyfikacji:
    PS: też będę przygotować prosty zestaw instrukcji o zainstalowaniu Menad┐era BOINC na Linux w “piaskownicy” (tj. w bezpieczne konto na białym tle). Tymczasem Użytkownicy Linuksa można również zajrzeć do pakietu instalacyjnego Debiana Linux i bezpieczeństwa BOINC
    Dodaj do zakładek lub polecam ten artykuł